iSSHというアプリを買って、サーバーにsshできるようになったのですが、ソフトウェアキーボードにはctrl,alt,esc,tab等のキーが無いため、iSSH側でソフトウェアボタン?として用意されています。
で、ハードウェアキーボードを繋いで試してみたのですが、ソフトで用意されている前述のこれらのキーは全て通してくれませんでした。
まさに、私も同じ問題でがっかりしたクチです。
特殊キーの時だけ、画面をタッチしなくてはいけないのが残念で、ちょっとiPadでsshするのめんどくさいと思わせるのに充分なんです。